changhappy 发表于 2007-8-21 11:52:03

[交流]试验设计,包括PB设计,响应面分析等

最近看了下论坛,发现很有朋友在培养基等试验设计方面感到无法下手,特别的是看到很多朋友对响应面分析很感兴趣,索取文献的特别多,还有一些朋友看过文献还不是很明白。
这方面的帖子发的很多,但是不集中,针对这些问题,我十分想把所有需要帮助的问题集中到一起,方便大家查询,交流。
另外希望熟悉试验设计的朋友参与进来,一同帮助需要帮助的朋友。我在试验设计方面发过一两篇文章,对试验设计略知一二,有需要帮助的朋友提出问题来,我将尽力而为。另外,需要文献的朋友,可以把检索的关键词发上来,不过限中文,发表时间太早的,也查不到。

西风 发表于 2007-8-21 13:03:45

楼主有心人!
建议给楼主物质奖励
我支持,我也有篇关于响应面的文章投出去了,正在审稿中

changhappy 发表于 2007-8-21 16:42:17

物质奖励就不必了,呵呵,只是看到大家对RSM比较感兴趣,刚好我又了解了一些,所以就想着留个记号,让需要帮助和可以帮助别人的战友都可以轻松的找到地方。顺祝西风早日收到接收函。

西风 发表于 2007-8-21 17:50:57

谢谢!我说的物质奖励指的是加经验或金币。。。不是RMB
确实做或者想做响应面的人很多
我那时做的时候也想找人帮忙,但是没有,那时进入发酵人论坛,后来自己看的外文说明一步一步做的
要是有人能整理一下确实对那些想用响应面的人来说是一个莫大的帮助!

changhappy 发表于 2007-8-22 11:47:16

谢谢西风,看你的回复我很有同感,我当时刚开始做RSM也是摸不到头脑,没办法,只有看文献一步一步的摸索过来的。
为了不让帖子沉了,也为了有需要的战友节省时间,心中对试验设计有个大概的框架,我先抛砖引玉,简单讲下我做培养基优化的一点体会。
可能有些战友认为,试验设计优化培养基就是找几种培养基成分放在一起做几个组合进行试验就行了,其实这样做往往是得不到最适的结果的,尤其在做响应面分析(RSM)的时候,试验得到的图形可能不是一个完美的曲面图,我见过一些别人发的文章,它的曲面图是一个扭曲的图形,高点根本没有出现在图形中,那试验得到的根本不是最适的培养基组分,当然这种文章一般不会出现在核心期刊上的。这种情况一般都是没有在做RSM前,做“爬坡试验”的结果,“爬坡试验”的目的在于找出RSM设计的中心点,保证结果的准确性。另外一点需要提出的是RSM的一个缺点就是分析的因素不能太多,经典的是三因素的试验设计,如果你的因素比较多,那不妨试试方开泰的均匀设计。要做RSM就要先找出有显著影响的因素,剔除一些对结果影响不显著的因素,所以在“爬坡试验”之前还需要一个PB试验,PB能从众多因素中很简单的找出对试验结果影响最为显著的因素,排除一些影响不显著的因素,降低后续试验的工作量,又能保证结果的准确性。PB和“爬坡试验”对于刚接触试验设计的战友,比较陌生点,加上发表文章中很少,全面的把整个试验设计写出来的,一般的都是只写RSM这部分,也有几篇文章是PB+RSM的,还有先做RSM后做“爬坡试验”的。我个人认为PB--“爬坡试验”--RS,这种试验设计的思路比较符合逻辑,又比较全面。如果做毕业论文的培养基优化部分,可以使内容比较丰富。当然如果是做毕业论文的话,在综合试验设计之前,还有个更基础的工作,就是单因素试验,那种放弃单因素试验的想法也完全错误的,尤其是没有一个基础配方的时候。我做的菌种是我自己从本实验室菌种库筛出来,然后又做了诱变育种,所以是没有合适的培养基的,所以做了很多工作,用单因素试验首先大致确定C、N、P、无机盐、微量元素的种类及水平。大致讲了一下,说的比较散乱,或许不太好明白。希望大家把问题提出来,我们一起针对具体问题具体分析。

细履平沙 发表于 2007-8-22 21:43:49

讲得不错,都是很好的心得。先用PB进行显著性分析是一个很好的建议。
另外可以从历史数据中找到合适的数据,然后再用软件进行分析,就可以不用再做实验就可找到影响显著的因素和水平范围。

zflzfl6767 发表于 2007-9-2 11:05:42

响应面分析,其实用我们常见的软件就可以做出来。首先对各个单因素的试验结果进行归纳,后选择变量的变化区间还变化间隔就可以,常见的软件如DPS就可以了。用这个软件可以完成你所需的所有工作,要是想让你的响应面好看,用MATLAB也可以,三维,四维的都可以,在MATLAB区中有我写的现成的用MATLAB语句实现第四维的表示方法,很好用。另外用SARS软件也是可以的,不过语句能比MATLAB复杂一点点。EXCEL也可以,不过做出的响应面,美观程度差一点点。

西风 发表于 2007-9-3 08:00:06

我有个想法,能不能在初始时用正交实验确定出中心点的范围,然后将数据用SAS中的主成份分析,得到影响最显著的几个因素,然后用RSM做,这样主要影响因素有了,中心点也有了。做起来也好做,不会PB等软件的战友也可以轻松操作。
不知这样可不可行?希望大家讨论讨论

西风 发表于 2007-9-3 16:13:29

发贴庆祝

应了changhappy的话,今天接到编辑部的邮件,稿件已被录用!
就是用上述方法作的!有兴趣的战友留个email,我可以发给大家,请大家指出不足之处!

tust1027 发表于 2007-9-4 04:40:57

求助一问题
四因素三水平的响应面分析,按Box-Behnken设计应该是有27组3个中心,为什么很多文献写的是21组5个中心,后者应该是small composite 设计的,请问是我理解错了还是文献有错误?另外这些不同的设计类型有什么不同,该怎么选?
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