[原创]C13标记的MFA计算过程的几个重要的概念

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the isotopomer distribution vector(IDV) 同位素异构体分布向量.
解释:如果一个分子有2个C原子,那么它可能有的同位素异构体的个数就是2^2=4个,如果用二进制表示则,四种分别是[00][01][10][11],[00]表示没有标记,[01]表示只有第1位标记,[10]只有第2个C原子标记,[11]表示2个C都标记,那么每种异构体占总的异构体的比例所组成的向量就是IDV.引入请注明出处(www.fajiaoren.com)
isotopomer mapping matrix(IMMs ):同位素异构体映射矩阵.
解释:如果一种物质R,生成另外一种物质S.如果知道它们之间原子的对照关系,那么这个矩阵就可以写了,它是由1和0组成.IDV(R)*IMM(R2S)-----IDV(S) 也就是说生成物S的IDV可以由R的IDV和IMM相乘得到,我一开始对IMM不理解,后来反复看文献,才清楚了一些.举个例子

如是 2个C的A  转换成了2个C的B  但是它们的C排列相反.  已经A的IDV为[0.8,0,0,0.2]  那么这个IMM就是
[0 0 0 1
0 0 0 0
0 0 0 0
1 0 0 0]    IMM*[0.8 0 0 0,2]'=[0.2 0 0 0.8]
这样大家是否很清楚了?
在文献中经常出现一个新词:cumomer 它的解释有以5部分.
Indicates 13C position only
Not directly measurable
Leaves degrees of freedom
Linear substitution from isotopomers
Creates linear network
对于这个词的理解,我也不是太好.所以不说了!

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In silico 是生物信息学的新名词,它是相对应于 in vivo (在活的有机体内)与 in vitro (在试管中,在生物体外)而产生的新名词,它强调使用电脑来解决生物学上的问题。

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jacobian matrix.
在代谢流计算过程中出現了Jacobi 矩陣，所謂Jacobi 矩陣是指一個向量對另一個向量的导数。几个应用案例请参考附件。