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菌株自动编码的规则,请高手提建议.

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发表于 2009-5-8 19:24:50 | 显示全部楼层 |阅读模式
2.3菌株自动编码系统
    在菌株编码方面,一是要求编码尽可能的简短便于登记,因为除了计算机进行编码外,还要在保存容器上手工贴上相同的标签。二是编码要有一定的意义,这样便于识别菌种的特性。在没有计算机辅助操作时,编号中除了菌种信息外,还要包括时间戳,这样虽然保证了不会出现重码,但是一次生成菌株多时,手工编码和登记工作也很繁重。为了实现这一要求,我们建议在软件管理系统中使用7位和9位编码。编码规则如下:
2.3.1前两位表示菌种名
    菌种通常使用种名+属名表示,比如红霉素生产菌株为Streptomyces erythreus,可以简写为SE;阿维菌素生产菌株为Streptomyces avermitilis,可以简写为SA。如果在企业中出现缩写形式相同的情况时,可以用产物缩写代表菌株,比如阿维菌素用AV表示,缩写形式应该由软件用户自己定义。
2.3.2第3位表示菌株性状差异
第3位表示原始菌株号,这个信息用1个字符表示。以区分性状有明显差异的同一菌种。比如公司目前有一株菌,后来又购买了另一株,那么这两株菌要通过这个字符进行区分。
2.3.3 第4位表示存放形式
目前,菌种保藏的方法包括斜面低温保藏法;液体石蜡;固体曲保藏法砂土管保藏冷冻干燥液氮超低温保藏法[4]。在自动编号系统中这几种保藏形式应该给予注明。保藏方法可以用一个简写字母表示。比如用S代表斜面(Slant),用P(plant)代表平板等,第四位的编码由用户自己进行定义。
2.3.4 第5位表示“传代数”
    菌种的信息还要包含传代数。软件中用1位10进制数字表示。根据调查,建议进行如下规定:
a. 单菌落分离出来的不同保藏形式代数都为第1代,比如从平板到斜面,那么无论是第几代平板,分离的单菌落制备的斜面都称为第1代,正常情况下一个单菌落制备一个斜面。
b. 如果不能区分单菌落,那么进行传代培养产物代数为父代+1。比如从1代斜面上刮取一点孢子接到另外一个斜面上,那么新制备的斜面定就为第二代。
2.3.5 第6~9位表示制备流水号
菌种编号中第6~7位是2位10进制流水号,这两位代表一次从父代生成多少个培养物。比如同一个平板中,传了6个斜面,那么这6个斜面编号就为01~06。因为可能会出现从同一平板不同时间挑单菌落培养的情况,这时计算机就自动按照顺序再增加第8位和第9位2个10进制流水号,一方面可以增加编号库容量,另一方面增强识别能力。
按照以上原则:图 5中生成了4个2代阿维菌素斜面,第6~7位是01,表示这是对其父代(包括非直系)进行的第2次操作。

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