菌种高通量筛选

halfz · 发表于 2008-1-22 09:09:13

我最近几年一直看到高通量筛选突变菌株或者新的菌株的，能大大提高筛选的效率。大家能来交流下具体的操作和注意事项么。或者有好的操作方式给提供下？

细履平沙 · 发表于 2008-1-22 18:25:19

我们实验室目前正在探索这方面的内容。以前制约因素是分析方面的，现在主要的制约因素是有特点的单菌落少。

yxp1717 · 发表于 2008-1-23 13:53:47

高通量没有搞过，学习学习哈，共同进步

chzhi163 · 发表于 2008-1-29 10:28:22

低调的问句,什么是高通量?有相关文章请介绍出来学习哈!

liwen.tan · 发表于 2008-1-29 16:55:26

我认为这主要还是硬件问题，江南大学孙志浩老师在一个讲座上提到这个，孙老师参观国外某著名制药公司的一套高通量筛选装置，说好像造价一亿美金吧，一个批次能筛选1000株吧。具体准确的我下次查实再发吧，还有一张照片

liwen.tan · 发表于 2008-1-30 09:33:29

对不起，昨天发的不太准确。应该是：孙老师参观杜邦公司，杜邦投资1000多万美元的高通量筛选装置处理量9600个/天（大平板-自动化机械臂操作-384/1536孔板-全自动色质联用）
这可能对投资是个挑战，斑竹是那家公司啊，眼光看得这么远
我现在做的诱变筛选就是，还只能是靠人工。
现在我主要做不对称还原酶的筛选，要是能找到特征筛选平板方法就好了。希望这方面的同行赐教啊

halfz · 发表于 2008-2-9 20:45:00

大家能把自己所了解的高通量筛选的方法给提供下参考么，我想搞菌种筛选的朋友估计都很想了解和借鉴下，对大家平时的工作会有不小的帮助的。
目前我正在查找这方面的文章，等找到了提供上来，也希望大家有的话传上来大家共享下。

河西走廊 · 发表于 2008-2-10 09:09:21

我们菌株筛选目前也没有好办法,先是形态观察进行初筛,然后进行第二次筛选(以发酵单位作为依据),选择高单位菌株,再以发酵单位作为依据进行复筛.最后保存下来,在生产中验证.我们目前正准备研究一下显微形态分析,然后选出单菌落.目前模型还没有做出来,因为也是如版主所说,受限于单菌落形态数据库.因为没有数据库,我们还不能进行形态与产量关联分析,大家有什么建议,我们可以共同完成,我发现论坛中有一个图像分析软件,对我们以后的工作会有帮助.

halfz · 发表于 2008-2-10 12:18:54

是啊，目前我主要是用推理选育方法，每次针对某一个问题设计一个筛选模型，大概从10的5次方个中挑出大约200个，然后摇瓶测定发酵单位进行复筛，最后保存，生产验证的。不知道有没有更好的方法筛选了。

halfz · 发表于 2008-2-26 14:27:32

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菌种高通量筛选

对不起，昨天发的不太准确

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